MMM脈動真空滅菌柜的滅菌原理是通過真空泵借助水的流動抽出滅菌柜室內冷空氣，使其處于負壓狀態，然后輸入飽和熱蒸氣，使其迅速穿透到物品內部，如此反復3次或4次。
在高溫和高壓力的作用下使微生物蛋白質變性凝固而滅活達到滅菌要求。滅菌后，抽真空使滅菌物品迅速干燥。工作流程采用電腦控制，具有方便、省時、省力、總滅菌時間短、滅菌可靠、物品干燥等特點，是醫院醫用物品消毒滅菌*的儀器之一。
MMM脈動真空滅菌柜工作時，微生物承受熱力作用后，蛋白質分子的運動會加速，互相撞擊，以此致使連接肽鏈的付鍵出現斷裂，其分子由具備規律性的緊密構造，轉變成無秩序的散漫構造，大量的疏水基會在分子表面暴露，并且相互融合為非常較大的聚合體而沉淀凝固，即借助不可逆地把結構蛋白和酶破壞掉，實現殺滅微生物的目的。
干燥階段，先抽真空將內部蒸汽抽出，然后再補入已過濾的熱壓縮空氣（滅菌柜有換熱器和除菌過濾器，壓縮空氣進入內腔首先先經過除菌過濾器過濾，然后經過換熱器加熱進入設備內腔，如果不加熱，冷壓縮空氣就會進入內腔使蒸汽凝結成水，不過濾就會引入細菌，滅菌失敗），連續重復幾次達到干燥效果。
在這里強調一下，干燥就是跟升溫差不多相反的一個過程。基本上程序沒問題的話，本來就是干燥的物品通過滅菌后都是干燥的，至于干燥次數一般根據滅菌物品來定，如果是器具的話次數會少一點，衣服的話次數多一點。
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